Peamine erinevus - minisatelliit vs mikrosatelliit
 

Korduv DNA on nukleotiidijärjestused, mis korduvad organismide genoomis ikka ja jälle. Korduv DNA moodustab olulise osa genoomsest DNA-st ja seal on kolm peamist tüüpi, mida nimetatakse tandemi kordusteks, terminaalseteks kordusteks ja vaheldumisi kordusteks. Tandemkordused on väga korduvad jadad, mis asuvad katkestusteta üksteise kõrval. Selgroogsete genoomis on kolm peamist tüüpi tandemikordust. Need on satelliit-DNA, mikrosatelliit-DNA ja minisatelliit-DNA. Minisatelliit on osa väga korduvast DNA-st, mis koosneb 10 kuni 100 aluspaarist koosneva korduva järjestuse seeriast. Mikrosatelliit on korduva DNA sektsioon, mis koosneb lühikestest korduvatest järjestustest, mis koosnevad 1 kuni 9 aluspaarist. Seetõttu on minisatelliidi ja mikrosatelliidi peamine erinevus korduva jada suurus või pikkus.

SISU

1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on minisatelliit
3. Mis on mikrosatelliit
4. Minisatelliidi ja mikrosatelliidi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - minisatelliit vs mikrosatelliit tabelina
6. Kokkuvõte

Mis on minisatelliit?

Minisatelliitne DNA on osa DNA-st, mis sisaldab lühikese DNA korduvat järjestust, mis on 10 kuni 60 aluspaari pikkune. Minisatelliite nimetatakse ka muutuva arvu tandemikordusteks (VNTR). Minisatelliite segatakse sageli mikrosatelliitidega. Nüüd eristatakse teadlasi korduva järjestuse suuruse põhjal minisatelliite ja mikrosatelliite.

Minisatelliite võib inimese genoomis näha enam kui 1000 asukohas. Need lühikesed järjestused on rikkad G ja C-ga. Korduste arv konkreetses minisatelliidis varieerub indiviiditi suuresti.

Erinevus minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel

Esimese inimese minisatelliidi leidsid A. R. Wyman ja R. White 1980. aastal. Hiljem avastas Alec Jeffreys organismide seas minisatelliitide eksemplari arvu äärmise polümorfismi. Need avastused tegid minisatelliidid ideaalseteks markeriteks DNA sõrmejälgede võtmisel, sidemete analüüsil ja populatsiooni uuringutel. Minisatelliidid aitavad kaasa ka geeniekspressiooni, transkriptsiooni, alternatiivse splaissingu jne reguleerimisele.

Mis on mikrosatelliit?

Mikrosatelliit on osa DNA-st, mille lihtsad järjestused korduvad 1 kuni 10 aluspaari. Mikrosatelliite nimetatakse ka lühikese järjestusega kordusteks (SSR) või lihtsateks tandemi kordusteks (STR). On kahte tüüpi mikrosatelliite, mida nimetatakse lihtsateks mikrosatelliitideks ja liitmikrosatelliitideks. Lihtsad mikrosatelliidid koosnevad ainult ühte tüüpi korduvatest järjestustest. Komposiit mikrosatelliidid koosnevad enam kui ühte tüüpi kordustest. Mikrosatelliitidel on kõige sagedamini polü A / T piirkonnad. Mikrosatelliidid on kodominantsed ja neid on eukarüootsetes genoomides palju.

Sarnaselt minisatelliitidega näitavad ka mikrosatelliidid üksikisikute seas polümorfismi. Korduste arv antud mikrosatelliidi korral on indiviiditi erinev. Seetõttu saab mikrosatelliite kasutada ka DNA sõrmejälgede võtmisel geneetiliste markeritena. Mikrosatelliidi polümorfismi saab hõlpsasti tuvastada PCR ja geelelektroforeesi abil. Mikrosatelliidi külgnev piirkond on sarnastes liikides väga konserveerunud.

Millised on sarnasused minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel?

  • Minisatelliidid ja mikrosatelliidid on mittekodeerivad DNA järjestused. Mõlemad on tandemkordused. Mõlemad koosnevad väga korduvatest järjestustest. Mõlemat saab kasutada DNA sõrmejälgede võtmise võimsate geneetiliste markeritena.

Mis vahe on minisatelliidil ja mikrosatelliidil?

Minisatelliit vs mikrosatelliit
Minisatelliidid on tandem-kordused monomeeri korduspikkusega 10 kuni 100 aluspaari.Mikrosatelliidid on lühikesed tandem-kordused, mis koosnevad 1 kuni 9 aluspaari monomeerist korduvatest järjestustest.
Korduva jada suurus
Minisatelliidil on korduvaid järjestusi 10 kuni 100 aluspaari.Mikrosatelliidil on lühikesed järjestused 1 kuni 9 aluspaari.
Ühised alused
Minisatelliidid on rikkad G- ja C-alustega.Mikrosatelliidid on rikkad A- ja T-alustega.
Muud nimed
Minisatelliite tuntakse ka muutuva arvu tandemikordustena (VNTR).Mikrosatelliite tuntakse ka lühikese järjestusega kordustena (SSR) või lihtsate tandemikordustena (STR).

Kokkuvõte - minisatelliit vs mikrosatelliit

Minisatelliit ja mikrosatelliit on kahte tüüpi tandemi kordusi. Neid eristatakse korduvas jadas olevate aluste arvu või jada suuruse põhjal. Minisatelliidil on 10 kuni 100 aluspaari korduvat järjestust, mikrosatelliidil aga 1 kuni 9 aluspaari korduvat järjestust. See on peamine erinevus minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel. Korduvate järjestuste koopiate arv minisatelliitides ja mikrosatelliitides on indiviidide vahel väga erinev. Nii minisatelliidid kui ka mikrosatelliidid on võimsad DNA markerid geneetiliste variatsioonide analüüsimiseks liikide populatsioonide sees ja nende vahel.

Laadige alla versiooni Minisatellite vs Microsatellite

Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja seda võrguühenduseta otstarbel kasutada tsitaatide märkuste kohaselt. Laadige alla PDF-versioon siit. Erinevus mini- ja mikrosatelliidi vahel.

Viited:

1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. “Suured erinevused”. Erinevus minisetelliidi ja mikrosatelliidi vahel. N.p., n.d. Võrk. Saadaval siin. 06. juuli 2017.
2.Vieira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz ja Carla De Freitas Munhoz. “Mikrosatelliitmarkerid: mida nad tähendavad ja miks nad on nii kasulikud.” Geneetika ja molekulaarbioloogia. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Veeb. Saadaval siin. 07. juuli 2017.

Pilt viisakalt:

1. Madelyndotsoni “VNTRnäide” - Omad tööd (CC BY-SA 4.0) Commonsi Wikimedia kaudu